MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019438	A	6	6	1183	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019438	AGA	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019438	ATA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019438	GTT	2	6	2507	2512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019438	T	7	7	2519	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019438	ATA	2	6	2528	2533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019438	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019438	CTTTT	2	10	2569	2578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019438	GA	3	6	2588	2593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019438	T	7	7	2667	2673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019438	TTA	2	6	2689	2694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019438	T	12	12	2700	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019438	TTA	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019438	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019438	AT	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019438	TGA	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019438	AT	3	6	2925	2930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019438	TGA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019438	AT	3	6	3083	3088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019438	TGA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019438	AT	3	6	3241	3246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019438	TGA	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019438	TCT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019438	TAT	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019438	A	9	9	3455	3463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019438	GTA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019438	AT	3	6	3473	3478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019438	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019438	ATTTT	2	10	3519	3528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019438	TAA	2	6	3553	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019438	T	7	7	3562	3568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019438	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019438	ATA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019438	GAT	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019438	CTTTT	2	10	3721	3730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019438	GA	3	6	3740	3745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019438	ATTA	2	8	3817	3824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019438	T	7	7	3825	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019438	TTA	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019438	T	8	8	3857	3864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019438	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019438	TCT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019438	GAT	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019438	TTG	2	6	3977	3982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019438	TATAT	2	10	4008	4017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019438	A	8	8	4044	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019438	A	8	8	4088	4095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019438	AC	3	6	4102	4107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019438	A	8	8	4110	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019438	AC	3	6	4124	4129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019438	A	8	8	4132	4139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019438	AC	3	6	4146	4151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019438	TTA	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019438	ATA	2	6	4184	4189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.